可以申请。如果想把两个权利人放在证书上，需要提供一份合作开发协议。可以向代理处申请。代理机构会给你一份合作开发协议的模板，可以在上面签字盖章。
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软件著作权合作开发，但不能申请合作协议？
当然，可以和公司的这些协议一起申请，也可以签订合作协议来明确著作权的所有权。
如何填写团队发展软件软件著作权申请表？
当然，可以和公司的这些协议一起申请，也可以签订合作协议来明确著作权的所有权。
软件著作权的合作开发属于什么？急迫的
两个以上的自然人、法人或者其他组织开发软件的，著作权的所有权由合作开发者签订书面合同约定。如果没有书面合同或合同中没有明确的约定，合作开发的软件可以单独使用，开发方可以对彼此开发的部分分别享受著作权的优惠；然而，当行使著作权时，它不应扩展到软件的合作开发和著作权的整体。如果软件的合作开发不能单独使用，其著作权应由所有合作开发商共享，并通过协商一致行使；如果不能达成一致意见且无正当理由，任何一方不得阻止另一方行使除转让权以外的其他权利，但收益应合理分配给所有合作开发商。
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